في إطار تنظيم وتنسيق أعمال الإتحاد بما يساعد في تحقيق أهدافه، فقد تم تكوين ثلاثة لجان رئيسية دائمة وهي

• اللجنة العلمية
• اللجنة المدرسية
• لجنة العلاقات العامة والإعلام

من شأن هذه اللجان أن تتولى جميع ما يتعلق بالأنشطة والبرامج والمشاريع التي ينفذها الإتحاد من بعد اعتمادها من قبل مجلس الإدارة.

كذلك هناك لجنتين إضافيتين مستقلة، الأولى تعني بجائزة المعلم المثالي للتربية البدنية،

والثانية تعني بالتخطيط والتطوير لكل ما يتعلق بالإتحاد.

كل لجنة من تلك اللجان تتكون من رئيس وستة أعضاء بحد أقصى.